平日の朝、仕事や約束に急ぐ人々で歩道があふれる賑やかな街を想像してみてください。これを顕微鏡レベルで想像してみると、何千もの異なる種の何兆もの微生物（微生物叢または微生物とも呼ばれます）で構成される、私たちの体内のマイクロバイオームがどのようなものであるかがわかります。 [1] これらには細菌だけでなく、真菌、寄生虫、ウイルスも含まれます。健康な人では、これらの「虫」は平和に共存しており、その数が最も多いのは小腸と大腸ですが、体全体にも存在します。マイクロバイオームは、人体のスムーズな日常動作を促進する上で非常に多くの重要な役割を果たしているため、支持器官とさえ呼ばれています。

各人は、もともとその人の DNA によって決定される、完全にユニークな微生物叢のネットワークを持っています。人は乳児の頃、産道での出産中および母親の母乳を通じて初めて微生物にさらされます。 [1] 乳児がどの微生物にさらされるかは、母親の体内で見つかった微生物の種類によってのみ異なります。その後、環境への曝露や食事によってマイクロバイオームが変化し、健康に有益な場合もあれば、病気のリスクが高まる場合もあります。

マイクロバイオームは、役に立つ微生物と潜在的に有害な微生物の両方で構成されます。ほとんどは共生的 (人体と微生物叢の両方に利益をもたらす) ものですが、少数ながら病原性 (病気を促進する) なものもあります。健康な体では、病原性微生物叢と共生微生物群が問題なく共存しています。しかし、感染症、特定の食事、抗生物質や他の細菌を破壊する薬の長期使用によってそのバランスが崩れると、腸内毒素症が発生し、これらの正常な相互作用が停止します。その結果、体が病気にかかりやすくなる可能性があります。