想像一下一個工作日早晨熙熙攘攘的城市，人行道上擠滿了匆忙上班或赴約的人們。現在從微觀層面想像一下，您就會了解我們體內的微生物組是什麼樣子，它由數千種不同物種的數万億微生物（也稱為微生物群或微生物）組成。 [1] 這些不僅包括細菌，還包括真菌、寄生蟲和病毒。在健康人體內，這些“細菌”和平共處，其中數量最多的地方是小腸和大腸，而且遍布全身。微生物群甚至被稱為支持器官，因為它在促進人體日常順利運作方面發揮著許多關鍵作用。

每個人都有一個完全獨特的微生物群網絡，最初由一個人的 DNA 決定。一個人在嬰兒時期首先接觸微生物，是在產道分娩期間通過母親的母乳接觸的。 [1] 嬰兒具體接觸了哪些微生物完全取決於在母親體內發現的微生物種類。之後，環境暴露和飲食可以改變一個人的微生物組，使其對健康有益或使一個人面臨更大的疾病風險。

微生物組由既有益又可能有害的微生物組成。大多數是共生的（人體和微生物群都受益），還有一些少量是致病的（促進疾病）。在健康的身體中，致病微生物群和共生微生物群可以毫無問題地共存。但如果這種平衡受到干擾（由傳染病、某些飲食或長期使用抗生素或其他殺菌藥物引起），就會出現菌群失調，從而停止這些正常的相互作用。結果，身體可能變得更容易患病。