Glykogen ist ein mehrfach verzweigtes Polysaccharid der Glukose, das bei Tieren, Pilzen und Bakterien als Energiespeicher dient. Die Polysaccharidstruktur stellt die Hauptspeicherform von Glukose im Körper dar.

Glykogen fungiert als eine von zwei Formen von Energiereserven: Glykogen dient der kurzfristigen Speicherung und die andere Form dient der Speicherung von Triglyceriden im Fettgewebe (d. h. Körperfett) zur langfristigen Speicherung. Beim Menschen wird Glykogen hauptsächlich in den Zellen der Leber und der Skelettmuskulatur hergestellt und gespeichert. In der Leber kann Glykogen 5–6 % des Frischgewichts des Organs ausmachen, und die Leber eines 1.5 kg schweren Erwachsenen kann etwa 100–120 Gramm Glykogen speichern. Im Skelettmuskel kommt Glykogen in geringer Konzentration vor (1–2 % der Muskelmasse) und der Skelettmuskel eines 70 kg schweren Erwachsenen speichert etwa 400 Gramm Glykogen. Die Menge an Glykogen, die im Körper – insbesondere in den Muskeln und der Leber – gespeichert ist, hängt hauptsächlich vom körperlichen Training, dem Grundumsatz und den Essgewohnheiten ab. Kleine Mengen Glykogen kommen auch in anderen Geweben und Zellen vor, darunter in den Nieren, roten Blutkörperchen, weißen Blutkörperchen und Gliazellen im Gehirn. Die Gebärmutter speichert während der Schwangerschaft auch Glykogen, um den Embryo zu ernähren.

Im Blut des Menschen sind ständig etwa 4 Gramm Glukose vorhanden; Bei nüchternen Personen wird der Blutzuckerspiegel auf Kosten der Glykogenspeicher in der Leber und der Skelettmuskulatur konstant auf diesem Niveau gehalten. Glykogenspeicher im Skelettmuskel dienen als Energiespeicher für den Muskel selbst; Der Abbau von Muskelglykogen behindert jedoch die Aufnahme von Muskelglukose aus dem Blut und erhöht dadurch die Menge an Blutglukose, die für die Verwendung in anderen Geweben verfügbar ist. Die Glykogenspeicher der Leber dienen als Glukosespeicher zur Verwendung im gesamten Körper, insbesondere im zentralen Nervensystem. Das menschliche Gehirn verbraucht bei nüchternen, sitzenden Personen etwa 60 % des Blutzuckers.

Glykogen ist das Analogon von Stärke, einem Glukosepolymer, das in Pflanzen als Energiespeicher fungiert. Es hat eine ähnliche Struktur wie Amylopektin (ein Bestandteil von Stärke), ist jedoch stärker verzweigt und kompakter als Stärke. Beide sind im trockenen Zustand weiße Pulver. Glykogen kommt in vielen Zelltypen in Form von Granulat im Zytosol/Zytoplasma vor und spielt eine wichtige Rolle im Glukosezyklus. Glykogen bildet eine Energiereserve, die schnell mobilisiert werden kann, um einen plötzlichen Bedarf an Glukose zu decken, die jedoch weniger kompakt ist als die Energiereserven von Triglyceriden (Lipiden). Als solches kommt es auch als Speicherreserve in vielen parasitären Protozoen vor.